Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCANP13611 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCANP13611 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCANP13611 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCANP13611 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCANP13611 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCANP13611 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCANP13611 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCANP13611 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCANP13611 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCANP13611 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCANP13611 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCANP13611 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCANP13611 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCANP13611 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCANP13611 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCANP13611 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCANP13611 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCANP13611 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCANP13611 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCANP13611 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCANP13611 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCANP13611 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCANP13611 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCANP13611 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCANP13611 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCANP13611 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCANP13611 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms