Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPD1P10809 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPD1P10809 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPD1P10809 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPD1P10809 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPD1P10809 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HSPD1P10809 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HSPD1P10809 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HSPD1P10809 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms