Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms