Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMIM10L2AP0DMW4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMIM10L2AP0DMW4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms