Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP10P09238 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP10P09238 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP10P09238 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP10P09238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP10P09238 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP10P09238 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP10P09238 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP10P09238 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMP10P09238 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP10P09238 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP10P09238 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP10P09238 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP10P09238 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP10P09238 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP10P09238 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP10P09238 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP10P09238 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP10P09238 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP10P09238 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP10P09238 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP10P09238 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP10P09238 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms