Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP3A4P08684 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP3A4P08684 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms