Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRPRAP08240 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRPRAP08240 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms