Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NGFRP08138 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NGFRP08138 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NGFRP08138 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NGFRP08138 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NGFRP08138 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NGFRP08138 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms