Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSF1RP07333 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CSF1RP07333 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms