Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYCNP04198 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYCNP04198 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYCNP04198 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYCNP04198 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYCNP04198 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYCNP04198 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYCNP04198 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYCNP04198 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYCNP04198 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYCNP04198 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MYCNP04198 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYCNP04198 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYCNP04198 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYCNP04198 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYCNP04198 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYCNP04198 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYCNP04198 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYCNP04198 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYCNP04198 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYCNP04198 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms