Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGGP02679 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGGP02679 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGGP02679 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGGP02679 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGGP02679 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGGP02679 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FGGP02679 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGGP02679 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGGP02679 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGGP02679 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGGP02679 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGGP02679 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGGP02679 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGGP02679 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms