Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOA2P02652 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOA2P02652 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APOA2P02652 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOA2P02652 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOA2P02652 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOA2P02652 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOA2P02652 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
APOA2P02652 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOA2P02652 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOA2P02652 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOA2P02652 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOA2P02652 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOA2P02652 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOA2P02652 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOA2P02652 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms