Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOEP02649 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOEP02649 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOEP02649 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOEP02649 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOEP02649 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOEP02649 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APOEP02649 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOEP02649 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOEP02649 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOEP02649 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOEP02649 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APOEP02649 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOEP02649 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOEP02649 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOEP02649 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOEP02649 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOEP02649 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOEP02649 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOEP02649 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOEP02649 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOEP02649 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms