Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNNC2P02585 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNNC2P02585 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms