Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TIMP1P01033 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TIMP1P01033 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms