Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
F2P00734 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F2P00734 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F2P00734 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F2P00734 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F2P00734 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F2P00734 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
F2P00734 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
F2P00734 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
F2P00734 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
F2P00734 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
F2P00734 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P00734 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P00734 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P00734 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P00734 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P00734 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F2P00734 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F2P00734 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
F2P00734 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F2P00734 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F2P00734 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms