Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOP3BO95985 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TOP3BO95985 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms