Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD3O95983 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD3O95983 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD3O95983 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD3O95983 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD3O95983 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD3O95983 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD3O95983 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD3O95983 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD3O95983 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD3O95983 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD3O95983 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD3O95983 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD3O95983 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD3O95983 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MBD3O95983 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD3O95983 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD3O95983 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms