Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYNGR4O95473 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYNGR4O95473 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms