Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCB11O95342 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB11O95342 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB11O95342 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms