Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLSTN1O94985 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLSTN1O94985 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms