Protein–RNA interactions for Protein: O94929

ABLIM3, Actin-binding LIM protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM3O94929 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ABLIM3O94929 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABLIM3O94929 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms