Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CREB3O43889 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CREB3O43889 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3O43889 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3O43889 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3O43889 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3O43889 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CREB3O43889 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CREB3O43889 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3O43889 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3O43889 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3O43889 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CREB3O43889 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3O43889 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3O43889 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CREB3O43889 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CREB3O43889 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms