Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRC1O43663 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRC1O43663 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRC1O43663 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRC1O43663 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRC1O43663 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRC1O43663 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRC1O43663 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRC1O43663 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRC1O43663 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRC1O43663 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRC1O43663 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRC1O43663 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRC1O43663 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRC1O43663 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRC1O43663 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRC1O43663 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRC1O43663 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRC1O43663 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRC1O43663 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRC1O43663 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRC1O43663 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRC1O43663 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms