Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP2AO43633 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms