Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM44O43615 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMM44O43615 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms