Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CBFA2T2O43439 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CBFA2T2O43439 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms