Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEFVO15553 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEFVO15553 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEFVO15553 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEFVO15553 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEFVO15553 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEFVO15553 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEFVO15553 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEFVO15553 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEFVO15553 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEFVO15553 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEFVO15553 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms