Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCF2LO15068 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCF2LO15068 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCF2LO15068 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms