Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
U2SURPO15042 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
U2SURPO15042 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms