Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLGNO14967 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLGNO14967 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLGNO14967 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLGNO14967 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLGNO14967 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLGNO14967 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLGNO14967 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLGNO14967 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLGNO14967 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms