Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GIPC1O14908 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms