Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCANO14594 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCANO14594 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCANO14594 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCANO14594 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCANO14594 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCANO14594 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCANO14594 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NCANO14594 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCANO14594 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCANO14594 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCANO14594 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCANO14594 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NCANO14594 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NCANO14594 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NCANO14594 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NCANO14594 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NCANO14594 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NCANO14594 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCANO14594 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCANO14594 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms