Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ELL2O00472 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ELL2O00472 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ELL2O00472 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ELL2O00472 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ELL2O00472 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ELL2O00472 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELL2O00472 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELL2O00472 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELL2O00472 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELL2O00472 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELL2O00472 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELL2O00472 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ELL2O00472 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ELL2O00472 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELL2O00472 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELL2O00472 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ELL2O00472 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ELL2O00472 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ELL2O00472 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ELL2O00472 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ELL2O00472 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms