Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PIK3C2AO00443 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PIK3C2AO00443 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PIK3C2AO00443 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms