Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NFKBIEO00221 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NFKBIEO00221 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NFKBIEO00221 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms