Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3KTA2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3KTA2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3KTA2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3KTA2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3KTA2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3KTA2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3KTA2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3KTA2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3KTA2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KTA2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KTA2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KTA2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KTA2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KTA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KTA2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3KTA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms