Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
H3BQV1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H3BQV1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H3BQV1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BQV1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BQV1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQV1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQV1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQV1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQV1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQV1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BQV1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQV1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQV1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQV1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQV1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQV1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BQV1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BQV1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BQV1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BQV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BQV1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BQV1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms