Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRDCB7Z8K6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms