Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVV-1B6SEH8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVV-1B6SEH8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERVV-1B6SEH8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms