Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PALM2-AKAP2B1ALY0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms