Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PP2D1A8MPX8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PP2D1A8MPX8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms