Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MEIS3P2A8K0S8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MEIS3P2A8K0S8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms