Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRRM3A6NNA2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRRM3A6NNA2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRRM3A6NNA2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms