Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC69A6NI79 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC69A6NI79 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms