Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
C9orf92A6NGG3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms