Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEMP2A6NFY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEMP2A6NFY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms