Protein–RNA interactions for Protein: A6NDY0

PABPN1L, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1LA6NDY0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PABPN1LA6NDY0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PABPN1LA6NDY0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms