Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSDA5PKW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSDA5PKW4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms