Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMEM89A2RUT3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM89A2RUT3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms